كشف محمد الحناوى رئيس النقابة المستقلة للعاملين بالجامعة العمالية، أن الجامعة تُعانى من العديد من المشاكل، على رأسها عدم وجود إدارة متخصصة تتولى إدارتها، خاصة أن المسئول عن إدارتها حاليًا هى المؤسسة الثقافية العمالية، وهى جهة ليست أكاديمية وغير مؤهلة لإدارة الجامعة العمالية